Lehninger Oppgave nr. 7 c)-f) s. 42 Phosphoryl Carboxyl Aldehyde Amino Amido Methyl Hydroxyl c) Phosphoenolpyruvat d) Threonin e) Pantothenat f) N-glucosamin

Lehninger Oppgave nr. 8 s. 42 angir det (eneste) chirale senteret til isoproterenol. D-isomeren kan interagere med biologisk reseptor (protein). L-isomer binder ikke på grunn av annen stereoisomeri.

Lehninger Oppgave nr. 6 s. 113 a) Chiralt senter Mulighet for sammensetning rundt et atom til to former som er speilvendte av hverandre Karbonatom bundet til fire ulike grupper Antall chirale sentre = 2 b) Antall chirale sentre = 2 2n der n er chirale sentre 22 = 4 dvs. fire stereoisomere

c)

Lehninger Oppgave nr. 8 s. 113 682 aminosyrer Gjennomsnitts molekylvekt er 128 g/mol Mister vann ved dannelse av peptidbinding, 18,6/mol Ny snittvekt er 128 – 18 = 110 g/mol 682 * 110 g/mol = 75 020 Da dvs. 75 kDa

Del I Oppgave 1 a) b) +1 pKa1 0 pKa2 -1 pKa3 -2 Glutamat: pI = (pKa1 + pKa2) / 2 = 2,2 + 4,3 / 2= 3,25 c) HA A- + H+ Start: 1 0 0 Likevekt: 1-x x x pH = pKa + log([A-]/[HA]) 9,7 = 9,7 + log(x/1-x) x = 0,5 Nettoladning: -1(1-x) + -2(x) = -1(1-0,5) + -2(0,5) = -1,5

Del I Oppgave 2 a) +2 pKa1 +1 pKa2 0 pKa3 -1 b) pI = (pKa2 + pKa3) / 2 = 8,95 + 10,53 = 9,74

V01 Oppgave I A 1. pI = (pKahis + pKaNH3) / 2 Navn: Antall: pKa sidekjede: pH 5 pH 7 pH 9,5 pH 11 Alanin 12 Arginin 1 13 +1 Asparagin Aspartat 4 -1 Cystein 10 Fenylala. Glutamin Glutamat Glycin 7 Histidin 6 Isoleucin 16 Leucin 14 Lysin Metionin 3 Prolin 2 Serin Treonin Tryptofan Tyrsosin Valin COOH NH3 9 o Ladning -4 V01 Oppgave I A 1. pI = (pKahis + pKaNH3) / 2

2. Hvilke likevekter gjelder? pI = (pKahis + pKaNH3) / 2 pI = (6 + 9) / 2 = 7,5 3. Det er 82 hydrofobe og 11 hydrofile aminosyrer i proteinet. Proteinet er hydrofobt. Integrerte membranproteiner er hydrofobe. Perifere membranproteiner er assosiert til membranen, men er i et hydrofilt miljø og er derfor hydrofile. Ut i fra aminosyre sammensetningen er dette er integrert membranprotein.

V00 Oppgave I B 1. 2. Cystein Tyrosin H O H

4. Overvekt av sure sidegrupper som blir negativt ladet ved avgivelse av H+. Proteinet har derfor pI lavere enn 7 og er surt. 3. Serin Strukturelt lik og polar sidekjede

H00 Oppgave 1 I A: met-leu-leu-ile-ile-val-val-phe-ile-ile-leu-ala-ile-phe-gly B: cys-ser-lys-asn-gln-lys-lys-arg-lys-arg-arg-lys-thr-his C: ser-asp-cys-asp-ser-thr-gly-asn-gln-glu-glu-glu-ser-asn D: met-ile-ala-phe-val-ala-ile-leu-val-ile-leu-ala-ile-val-ala-val E: asp-thr-glu-asp-glu-gly-glu-glu-asp-asp-thr-ala-glu-asp-ser Overflate = hydrofil Indre = hydrofob

4. V00 Oppgave 1 A Lys-Ala vs Val-Ala pH 7 Polaritet og ladning? + Arg-Leu vs His-Leu ved pH 8 Asp-Ile ved pH 2 vs Asp-Ile ved pH 7 Polaritet og ladning? -