Hovedoppgave 04-06 Ved HIB/UIB Informatikk Bruk av MATLAB for visualisering og analyse av FREESURFER-segmenterte MRI-opptak av den aldrende hjerne.

Slides:



Advertisements
Liknende presentasjoner
Hvor står vi Hva gjør vi Hvor går vi
Advertisements

Meeting 8th of September 2004
Prosessarbeid med collage, tekstur og formlikhet
Pilotprosjektet så langt
KOSTRA KOmmune STat RApportering
Frode B. Nilsen Drifts- og utviklingssjef, BankID Norge
Oppmerksomt nærvær/ Mindfulness
Kunnskapsløftet og sammensatte tekster
Agenda Strategi i nedgangstider; Hvem vinner? Professor på NHH, Lasse Lien deler interessante perspektiver på utfordringene som ligger foran oss.
Den digitale dimensjonen i læreplanen for naturfag
Introduksjon til MATLAB
Satellittfjernmåling med avanserte radarinstrumenter (UNIKF353, 2 vekttall) Innhold: Satellitter som plattform for radar. Satellittbaner, radarprinsipper,
Temadag Læring i prosjektpraksis Simulering som metode.
Datavarehus i skatteetaten -
Grunnleggende opptaksteknikker
Et Prosjekt av: Truls Haaland Åsmund Østvold Alf Solbakken
1 ProsjektProsjekt Våren OppgaverOppgaver Matematisk behandling av medisinsk bilde-informasjon. Oppgavene vil i hovedtrekk omhandle ulike matematiske.
1 ProsjektProsjekt Våren OppgaverOppgaver Matematisk behandling av medisinsk bilde-informasjon. Oppgavene vil i hovedtrekk omhandle ulike matematiske.
1 Helse / IT Databaser
1 ProsjektProsjekt Våren Digital bildebehandling -Utvikle generelle bildebehandlingsrutiner i Java -Bruk av Wavelets i digital bildebehandling.
1 Helse / IT Databaser. 2 InnholdInnhold -Presentasjon (m/IT-helse ved HiA) -OppsummeringDatabase - Tabeller - Modellering - SQL -Database-demo -Strukturering.
Grafikkprosessering på sky. Grafikkprosessering Grafikkprosessering = Render Lage bilder ved hjelp av datamaskiner Animasjon krever massiv datakraft.
Mindfulness Oppmerksomt nærvær
IN229 – Våren 2003 Oversikt over innhold IN229/ V03 / Dag 12 Simulering i IN229 Simulatorkode –Proseduralt (FORTRAN / C) –Objekt-orientert (C++)
Mastergrad Miljøinformatikk
9 februar, Hroar Piene, dr.med. konsulent for KITH NCMP- NORSK KLASSIFIKASJON AV MEDISINSKE PROSEDYRER,
Utfordringer i familien
Pasientsikkerhet ved ultralyd
Farvel til applikasjonsserveren Fra kompleksitet til kontroll.
Maskinlæring / robot-teknologi. 2 ”Humanoid” design - visjon eller virkelighet? T1 – endoskeleton Winston group.
PROGRAMFAG MATEMATIKK
Produksjonslogistikk En strategisk satsning SINTEF teknologiledelse
Del 7 Volumavbildning. INF2340 / V042 Klassifikasjon Volumvisualisering FlateavbildningVolumavbildning Isoflater Snittplan visualisering av volumetrisk.
3) Analyse (SoPK) for dypere kunnskap
Bachelorprosjekt - Oppgave 17E
1 Kap. 17 – Interactive computing How Information Technology Is Conquering the World: Workplace, Private Life, and Society Professor Kai A. Olsen, Universitetet.
1 Kap. 17 – Interactive computing How Information Technology Is Conquering the World: Workplace, Private Life, and Society Professor Kai A. Olsen, Universitetet.
Bruk av alkohol og medikamenter blant eldre (60+) i Norge.
Gjennomgang av oblig 1, DRI 2002, V-06 Dag Wiese Schartum, AFIN.
Workshop, Dokka – 9. nov
LAVA - hvordan stimulerer teknologi ? Anders Kluge Stipendiat og forsker Institutt for Informatikk og Norsk Regnesentral.
MÅLRETTET MILJØARBEID
Database for medisinsk programvare Øyvind W. Kvalsund.
PRESENTASJON AV ULMATEC. 2 DETTE ER OVERSKRIFT  Punkt  Underpunkt A PRESENTATION OF ULMATEC.
Gruppeundervisning /
Erfaringsbasert Læring med Linux ”Finne metoder og verktøy for å analysere handlinger hos Linux eksperter.” Hovedoppgave våren 2004 Jonas Alver.
Optimalisering av bildebehandling for diagnose av hudsykdommer 27.Mars, 2008 Svein Even Vikshåland Veileder: Dhayalan Velauthapillai.
Administrasjons- program for Cluster i HLT CERN - ALICE Torstein Thingnæs.
VirusLab Utvikling av en profesjonell applikasjon.
Omsorgsteknologi ved HiB
Presentasjon av hovedprosjekt ”PC-basert keyboard og display for AIS”
Avdeling for informatikk og e-læring Prosjektgruppe 19c 1 Oppsett, drift og distribusjon av Vista Prosjektgruppe 19c.
PROGRAMFAG MATEMATIKK Verdt å merke seg: Dersom du på Vg2 velger matematikk R1 eller S1: faller fellesfaget i matematikk (3 t) bort og du må ta enten:
Målinger og bruk av Extranet –nasjonale og lokale registreringer Vi vet hva vi skal måle på og hvorfor ? Prosess målinger: 1.Andel operasjoner der sjekkliste.
Forelesere ved Institutt for Økonomi og Informatikk ved HSN er oppdragsgivere i dette prosjektet. Videreutvikling av bachelor prosjektet PUR som ble gjennomført.
Masterprogram i informatikk
Hospitering Velkommen.
Fremgangsmåte for å gjennomfør SWOT
Miria Grisot og Margunn Aanestad
Per Henrik Hogstad Presentation - Mathematics - Statistics
Kvalitativ analyse ved bruk av NVivo11 Computer-Assisted Qualitative Data Analyses Software (CAQDAS) Ph.D Kurs ISP Steinar Theie.
Masterprogram i matematikk Masterprogram i statistikk
I noen tilfeller kan den være ganske lang. Sånn som dette.
Digitalisering og digital kompetanse
Demo Ny IT.
Høgskolen i Østfold tilbyr 60 studier i Halden, Sarpsborg og Fredrikstad
Per Henrik Hogstad Presentation - Mathematics - Statistics
I noen tilfeller kan den være ganske lang. Sånn som dette.
PROTO.IO INTERAKTIV PROTOTYPING.
I noen tilfeller kan den være ganske lang. Sånn som dette.
Utskrift av presentasjonen:

Hovedoppgave 04-06 Ved HIB/UIB Informatikk Bruk av MATLAB for visualisering og analyse av FREESURFER-segmenterte MRI-opptak av den aldrende hjerne Roy Kjellid

Bildediagnostikk Finnes flere ulike teknikker Klassifisere Røntgen Ultralyd MRI Klassifisere Manuell klassifikasjon Automatisk klassifikasjon

MRI MRI ”oppfunnet” av Bloch og Purcell Stor utvikling siste 20 år Segmenteringsteknikker Bildekvalitet Nye applikasjoner Applikasjoner Automatisk klassifikasjon FreeSurfer

”FREESURFER” Freesurfer er utviklet hos: Cortechs og Martinos Center for Biomedisinsk Avbildning Martinos Center er et samarbeid Harvard-Massachusetts Institute of Technology (MIT) Massachusetts General Hospital.

Hva gjør FreeSurfer: Vevsgjenkjenning og morfometri basert på MRI Freesurfer er det mest avanserte av slike verktøy

Hva gjør FreeSurfer: Tar utgangspunkt i ett eller flere T1-vektete 3D hodeopptak Automatisk segmentering av WM,GM,CSF Segmenterer også anatomiske strukturer

FreeSurfer FreeSurfer = Linux basert Visualiserings del i TCL/TK Mål med oppgaven: dels innsikt gjennom visualisering dels tilrettelegging og gjennomføring av statistiske analyser av segmenterte volumer og flater

Teknologi Hvorfor Matlab? Negative sider: MATLAB, Matematisk verktøy Mange ToolBoxes DICOM Virker på ulike plattformer Negative sider: Funksjons og script basert Bruker mye minne

VizFree VizFree Sentralisert Kontroll Arkitektur Bildebehandling og Matlab

VizFree – Visualisere DICOM

VizFree – Visualisere FreeSurfer aseg

VizFree – Volum og hjernestruktur

VizFree – Tydelige Bilder

VizFree – 3D

VizFree - Gruppeanalyse

Hvorfor? Måle ulike volumendringer Effekt av medisinering Sykdommer eller lidelser

Spørsmål?

HIB og Master…. Tilrettelegging? Software? Kompetanse?