SARS: Viruset og Status for virologisk diagnostikk Olav Hungnes Avdeling for infeksjoner som smitter via luftveiene, Folkehelseinstituttet

Jakten på smittestoffet •Første funn: vanlige influensavirus Kina nov-02; Chlamydia spp Kina feb-03; influensa B Hanoi mars; paramyxoviridae Tyskl.& Hongkong mars; hMPV (et paramyxovirus) Canada mars •Coronavirus? –CoV-lign. partikler sett i mulig SARS, Sverige i mars (materiale ikke tilgj. for videre undersøkelser) –CDC, HK Univ: elektronmikroskopi; dyrking; mikromatrise, "universell" CoV- PCR

Jakten på smittestoffet •Første funn: vanlige influensavirus Kina nov-02; Chlamydia spp Kina feb-03; influensa B Hanoi mars; paramyxoviridae Tyskl.& Hongkong mars; hMPV (et paramyxovirus) Canada mars •Coronavirus? –CoV-lign. partikler sett i mulig SARS, Sverige i mars (materiale ikke tilgj. for videre undersøkelser) –CDC, HK Univ: elektronmikroskopi; dyrking; mikromatrise, "universell" CoV-PCR

Jakten på smittestoffet •Første funn: vanlige influensavirus Kina nov-02; Chlamydia spp Kina feb-03; influensa B Hanoi mars; paramyxoviridae Tyskl.& Hongkong mars; hMPV (et paramyxovirus) Canada mars •Coronavirus? –CoV-lign. partikler sett i mulig SARS, Sverige i mars (materiale ikke tilgj. for videre undersøkelser) –CDC, HK Univ: elektronmikroskopi; dyrking; mikromatrise, "universell" CoV-PCR Corona - fugl Astro Corona - menneske

Dette motivet - fra astrovirus ? - var ett av de åtte treffene man først fant hos SARS-viruset - blant virus-sekvenser på brikken!

Et nytt coronavirus

Hva vet vi om SARS CoV? •Et helt nytt virus: •Første virus i en helt ny gruppe innenfor familien coronaviridae GRUPPE 4 ?

SARS CoV - genetisk organisering Marra et al., Science 1 Mai 2003 Pr. 5 mai: Sekvensinformasjon fra ca. 10 virus, begrenset informasjon om genetisk variasjon

SARS og det nye coronaviruset - evidens •Viruset påvist i høy andel av sannsynlige SARS-pasienter (PCR, dyrking) •Antistoff mot viruset i høy andel av sanns. SARS-pasienter • " ikke funnet hos friske kontroller. •Serum fra rekonvalesenter nøytraliserer viruset ved dyrking •Stigning i antistoff fra akutt- til rekonvalesent-serum (serokonversjon) •Primater podet med virus fikk SARS-lignende symptomer

Genetisk variasjon Foreløpig begrenset med informasjon Er det forskjeller mellom virusene og deres virulens?

Infeksjon og utskillelse av virus data fra: Peiris et al; Prospective study of the clinical progression and viral load of SARS-associated coronavirus pneumonia in a community outbreak Lancet in press

Stabilitet og inaktivering •stabilt i feces/urin, romtemp; 1-2 døgn, økt stabilitet v/høyere pH (diaré) •Stabilt v/ 4°C; romtemp, inaktiveres v/56 °C •inaktiveres i: aceton, formaldehyd (10%), klorin, 75% etanol, fenol (2%) (kilde: WHO 5 mai, mere detaljer kommer senere)

Diagnostikk •Å påvise infeksjon med SARS CoV •Å påvise infeksjon med andre agens som forklarer sykdom - sjekke ut de mange som ikke har SARS

SARS-diagnostikk i Norge •30 mars: Første PCR-protokoll offentliggjort (Bernhard Nocht- Institut, Hamburg) •Primere, reagenser og positiv kontroll-RNA bestilt og prøvd ut på FHI - klar ca 10 d senere •Flere sykehuslab har nå operativ RT-PCR diagnostikk for SARS-CoV - 1 lab gjør dyrking på SARS-prøver •FHI utpekt av HD som nasjonalt referanselaboratorium 5 mai •Etter vurdering kan prøver videresendes til internasjonale lab for tester vi (ennå) ikke har i Norge •Antistoff-test trolig tilgjengelig i løpet av mai

Konklusjoner •Store framskritt på kort tid - dette vil fortsette •Kjennskap til viruset åpner for: –Identifisering av smitte –Utvikling av behandling –Utvikling av vaksine –Forstå sykdom •Betydning av mikrobiologisk diagnostikk •Test-resultat nå med i kasusdefinisjon* •Serologisk utredning av tidl. utredede kasus •Fallgruber –Falske negative - falsk trygghet? –Ensidig fokus på feil agens (mindre sannsynlig nå)