SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH,

SNOMED CT Jostein Ven, KITH

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Systemized Nomenclature of Medicine – Clinical Terms • Begrepssystem utviklet av College of American Pathologists • ~ concepts • ~1,4 mill relations between concepts • ~19 top concepts in the system of concepts • 12 ”axes” (or ”independent” modules)

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Litt historie • SNOP (Systemized Nomenclature of Pathology) • Snomed (I/II) – seks akser • Den norske SNOMED • SNOMED III (SNOMED International) – elleve akser • • SNOMED RT • SNOMED CT = SNOMED RT + Clinical Terms v3 (Read Codes)

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Axes in SNOMED I and II • Topography • Morphology • Aetiology • Function • Disease/diagnosis • Procedure

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Akser i SNOMED III (”SNOMED International”) • Kilde: Coding matters, Vol. 8, No. 2, September 2001.

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, SNOMED RT code structure • Kilde: Coding matters, Vol. 8, No. 2, September 2001.

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Datastruktur i SNOMED CT

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, SNOMED CT – en terminologi/system av begreper Organisert gjennom • Kobling mellom begreper og termer • Relasjoner mellom begreper • Definerende relasjoner • Hierarkiske relasjoner (generisk – spesifikk) • Attributt-relasjoner • Kvalifikator-relasjoner (’fyll inn’)

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Hierarkisk nettverk gjennom is-a- relasjonen

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Core needle biopsy of nasal sinus i browser

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Veien opp til SNOMED CT CONCEPT

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Top concepts in SNOMED CT

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Relasjoner rangert etter hyppighet Relation nameNumber Is a Onset Finding site Course64202 Severity64144 Episodicity63952 Method62667 Associated morphology58642 Priority50319 Procedure site50284 Part of47821 Access43237 Causative agent32967 Interprets18185 Has active ingredient17360 Laterality16418 Occurrence10639

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Relasjoner og akser Relation nameACDFGJLMPRST Is a Onset Finding site Course Severity Episodicity Method Associated morphology Priority Procedure site Part of Access Causative agent Interprets Has active ingredient Laterality Occurrence

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Prosedyrer • Ca prosedyrebegrep totalt • Mapping til OPCS-4 • Ca 3000 prosedyrebegrep innen lab • Mapping til LOINC

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Eksempel på prosedyre SNOMED CT conceptAssociated conceptsRelation Brain structure (body structure)Procedure site Introduction - action (qualifier value)Method Diagnostic - procedure intent (qualifier value) Has intent Priorities (qualifier value)Priority Cerebral blood flow radionuclide study Intracranial vascular structure (body structure) Procedure site Surgical access values (qualifier value)Access Radionuclide imaging - action (qualifier value) Method Brain imaging with vascular flow (procedure) Is a Imaging - action (qualifier value)Method Blood vessel structure (body structure)Procedure site Radioactive isotope (substance)Direct substance

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Kobling til klassifikasjoner • Metodologi og tabeller for kobling (mapping) fra begreper i SNOMED CT til eksisterende klassifikasjoner • Definerte mappinger: • ICD-9-CM • ICD-10 • ICD-O • OPCS-4 • PDNS,NANDA, NIC, NOC

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Tables involved in cross mapping

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Cross mapping SNOMED CT to ICD-9-CM

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Klassifikasjon vs. terminologi SNOMED CT NCSP

SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, Eksempel på begreper • core needle biopsy of kidney • maligjnant neoplasm of skin of lower limb • meningitis due to typhoid fever • entire paranasal sinus cavity • Begrepene i SNOMED er ikke dekomponert, så for eksempelbegrepene vet vi ikke hvilke deler som tilsvarer hvilke innholdelementer, selv om vi ut fra relasjonene har et utgangspunkt for et subsett av innholdselementene i begrepet.