Database for medisinsk programvare Øyvind W. Kvalsund.

Presentasjon om: "Database for medisinsk programvare Øyvind W. Kvalsund."— Utskrift av presentasjonen:

1 Database for medisinsk programvare Øyvind W. Kvalsund

2 Eksisterende løsning Bilder lagret i filsystem Informasjonen lagret i filnavn Bruker script / Mathlab for å vise bilder

3 Min oppgave Lagre data –Bilder –Leger –Pasienter –Diagnose

4 Krav Valg av språk –Skal være Open Source

5 caBIG (cancer Biomedical Informatics grid) Prosjekt startet av National Institutes of Health (NIH) Åpen kildekode

6 caBIG Mål: –Finne åpen kildekode som kunne benyttes i masteroppgaven

7 caBIG Problem: –Bærer preg av å være uferdig –Lover og regler –Programvare utviklet primært for å dele data mellom ulike forskningsinstitusjoner –Utviklet for at institusjonene skal kunne benytte ulike databasespråk

8 «Optimalisering av bildebehandling for diagnose av hudsykdommer» 12.April, 2007 Svein Even Vikshåland

9 Prosessen Rå-bilder Kalibrering Geometrisk kalibrering Segmentering Fysiologi analyse Morfologi analyse Diagnose avbilding Level 0 Level 1 Level 2 Level 3

10 Oppgaven Arbeidsoppgaver –Matlab –Implementere level 1, 2, 3 –Linux –Språk: C++ Hva jeg har jobbet med til nå –Studert hva som skjer i prosessen. –Bibliotek

11 Fremdrift Klargjøre mulige feil Finne tiltak Integrering med ny database Ferdig 1.juni 2008

12 Visualisering av optimiserte digitale bilder av hudsykdommer Av Jan Martin Langeland

13 Min oppgave GUI-applikasjon (utviklingsverktøy) Hente ut informasjon fra optimiserte bilder –Melanom distribusjon –Blod distribusjon –Blodoksygen verdier –Etc. Vise informasjon i form av grafer og diagrammer. Lagring til database.

14 Prosessen Rå-bilder Kalibrering Geometrisk kalibrering Segmentering Fysiologi analyse Morfologi analyse Diagnose avbilding Level 0 Level 1 Level 2 Level 3

15 Utkast til applikasjon

16 Generelt Open Source Linux C++ Vim SVN

17 Påbegynt Begynt å teste ut bibliotek for tegning av grafer/diagrammer GUI: GTK+ eller Qt Bibliotek for bildebehandling