Presentasjon lastes. Vennligst vent

Presentasjon lastes. Vennligst vent

Mikrobiell evolusjon og systematikk Fylogeni: den evolusjonsmessige historien til organismer Taksonomi: klassifikasjon av organismer.

Liknende presentasjoner


Presentasjon om: "Mikrobiell evolusjon og systematikk Fylogeni: den evolusjonsmessige historien til organismer Taksonomi: klassifikasjon av organismer."— Utskrift av presentasjonen:

1 Mikrobiell evolusjon og systematikk Fylogeni: den evolusjonsmessige historien til organismer Taksonomi: klassifikasjon av organismer

2 Evolusjonær avstand måles ved å sammenligne 16S (eller 18S) rRNA gener. Metoden baserer seg på at: # sekvensforandringer er proporsjonalt med # mutasjoner som er proporsjonalt med avstand i tid bakover til felles ane

3

4

5 Signatursekvenser i 16S (18S) rRNA: Posisjon 910: AAACYCAAA(bakterier) AAACYYAAAG(archaea og eukaryote) Posisjon 1400: YACACACCG(bakterier og eukaryote) CACACACCG(archaea)

6

7

8 Klassisk taksonomi: -fenotype -biokjemiske tester Molekylær taksonomi: -DNA:DNA hybridisering -ribotyping -FAME

9

10

11 DNA:DNA hybridization as a taxonomic tool

12

13

14 FAME (fatty acid methyl ester analysis)

15 Sammenligning av to og to bakteriestammer Hvis samme art: >70% likhet i DNA sekvens

16

17 TaksonomiskEksempel: inndeling: Domenebakterier Fylum VII proteobakterier, seksjon XIX  -proteobakterier Klasse I Zymobakterier Orden X Vibrionales Familie I Vibrionaceae Slekt (genus)Vibrio Artcholerae


Laste ned ppt "Mikrobiell evolusjon og systematikk Fylogeni: den evolusjonsmessige historien til organismer Taksonomi: klassifikasjon av organismer."

Liknende presentasjoner


Annonser fra Google