Presentasjon lastes. Vennligst vent

Presentasjon lastes. Vennligst vent

Hovedoppgave 04-06 Ved HIB/UIB Informatikk Bruk av MATLAB for visualisering og analyse av FREESURFER- segmenterte MRI-opptak av den aldrende hjerne Roy.

Liknende presentasjoner


Presentasjon om: "Hovedoppgave 04-06 Ved HIB/UIB Informatikk Bruk av MATLAB for visualisering og analyse av FREESURFER- segmenterte MRI-opptak av den aldrende hjerne Roy."— Utskrift av presentasjonen:

1 Hovedoppgave Ved HIB/UIB Informatikk Bruk av MATLAB for visualisering og analyse av FREESURFER- segmenterte MRI-opptak av den aldrende hjerne Roy Kjellid

2 Bildediagnostikk Finnes flere ulike teknikker –Røntgen –Ultralyd –MRI Klassifisere –Manuell klassifikasjon –Automatisk klassifikasjon

3 MRI MRI ”oppfunnet” av Bloch og Purcell Stor utvikling siste 20 år –Segmenteringsteknikker –Bildekvalitet –Nye applikasjoner Applikasjoner –Automatisk klassifikasjon –FreeSurfer

4 ”FREESURFER” Freesurfer er utviklet hos: –Cortechs og Martinos Center for Biomedisinsk Avbildning Martinos Center er et samarbeid –Harvard-Massachusetts Institute of Technology (MIT) –Massachusetts General Hospital.

5 Hva gjør FreeSurfer: Vevsgjenkjenning og morfometri basert på MRI Freesurfer er det mest avanserte av slike verktøy

6 Hva gjør FreeSurfer: Tar utgangspunkt i ett eller flere T1-vektete 3D hodeopptak –Automatisk segmentering av WM,GM,CSF –Segmenterer også anatomiske strukturer

7 FreeSurfer FreeSurfer = Linux basert Visualiserings del i TCL/TK Mål med oppgaven: –dels innsikt gjennom visualisering –dels tilrettelegging og gjennomføring av statistiske analyser av segmenterte volumer og flater

8 Teknologi Hvorfor Matlab? –MATLAB, Matematisk verktøy –Mange ToolBoxes –DICOM –Virker på ulike plattformer Negative sider: –Funksjons og script basert –Bruker mye minne

9 VizFree VizFree Sentralisert Kontroll Arkitektur Bildebehandling og Matlab

10 VizFree – Visualisere DICOM

11 VizFree – Visualisere FreeSurfer aseg

12 VizFree – Volum og hjernestruktur

13 VizFree – Tydelige Bilder

14 VizFree – 3D

15 VizFree - Gruppeanalyse

16 Hvorfor? Måle ulike volumendringer Effekt av medisinering Sykdommer eller lidelser

17 Spørsmål?

18 HIB og Master…. Tilrettelegging?Software?Kompetanse?


Laste ned ppt "Hovedoppgave 04-06 Ved HIB/UIB Informatikk Bruk av MATLAB for visualisering og analyse av FREESURFER- segmenterte MRI-opptak av den aldrende hjerne Roy."

Liknende presentasjoner


Annonser fra Google