SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05.

Presentasjon om: "SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05."— Utskrift av presentasjonen:

1 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05

2 SNOMED CT Jostein Ven, KITH

3 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Systemized Nomenclature of Medicine – Clinical Terms • Begrepssystem utviklet av College of American Pathologists • ~350.000 concepts • ~1,4 mill relations between concepts • ~19 top concepts in the system of concepts • 12 ”axes” (or ”independent” modules)

4 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Litt historie • SNOP (Systemized Nomenclature of Pathology) • Snomed (I/II) – seks akser • Den norske SNOMED • SNOMED III (SNOMED International) – elleve akser • ------------------ • SNOMED RT • SNOMED CT = SNOMED RT + Clinical Terms v3 (Read Codes)

5 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Axes in SNOMED I and II • Topography • Morphology • Aetiology • Function • Disease/diagnosis • Procedure

6 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Akser i SNOMED III (”SNOMED International”) • Kilde: Coding matters, Vol. 8, No. 2, September 2001.

7 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 SNOMED RT code structure • Kilde: Coding matters, Vol. 8, No. 2, September 2001.

8 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Datastruktur i SNOMED CT

9 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 SNOMED CT – en terminologi/system av begreper Organisert gjennom • Kobling mellom begreper og termer • Relasjoner mellom begreper • Definerende relasjoner • Hierarkiske relasjoner (generisk – spesifikk) • Attributt-relasjoner • Kvalifikator-relasjoner (’fyll inn’)

10 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Hierarkisk nettverk gjennom is-a- relasjonen

11 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Core needle biopsy of nasal sinus i browser

12 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Veien opp til SNOMED CT CONCEPT

13 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Top concepts in SNOMED CT

14 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Relasjoner rangert etter hyppighet Relation nameNumber Is a447123 Onset114555 Finding site106394 Course64202 Severity64144 Episodicity63952 Method62667 Associated morphology58642 Priority50319 Procedure site50284 Part of47821 Access43237 Causative agent32967 Interprets18185 Has active ingredient17360 Laterality16418 Occurrence10639

15 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Relasjoner og akser Relation nameACDFGJLMPRST Is a97032962911430956779677550592719260589122657507141341473 Onset 112349212314 6 621 Finding site 880171796912 3572030844 Course 6304311137 3 36 Severity 6296711217 35 401 Episodicity 6284810597 3 332 Method81 103 126251231 Associated morphology21 58274313 3 31 Priority71 89 1250173361 Procedure site 1 110 1550142151 Part of 6711 87 32 47624 Access 1 80 124312222 Causative agent 32844112 62 12 Interprets 3421124155774 342081821006113 Has active ingredient 17202 143 410 1 Laterality 51 7 19 16386 Occurrence 10260368 101

16 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Prosedyrer • Ca 54.000 prosedyrebegrep totalt • Mapping til OPCS-4 • Ca 3000 prosedyrebegrep innen lab • Mapping til LOINC

17 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Eksempel på prosedyre SNOMED CT conceptAssociated conceptsRelation Brain structure (body structure)Procedure site Introduction - action (qualifier value)Method Diagnostic - procedure intent (qualifier value) Has intent Priorities (qualifier value)Priority Cerebral blood flow radionuclide study Intracranial vascular structure (body structure) Procedure site Surgical access values (qualifier value)Access Radionuclide imaging - action (qualifier value) Method Brain imaging with vascular flow (procedure) Is a Imaging - action (qualifier value)Method Blood vessel structure (body structure)Procedure site Radioactive isotope (substance)Direct substance

18 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Kobling til klassifikasjoner • Metodologi og tabeller for kobling (mapping) fra begreper i SNOMED CT til eksisterende klassifikasjoner • Definerte mappinger: • ICD-9-CM • ICD-10 • ICD-O • OPCS-4 • PDNS,NANDA, NIC, NOC

19 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Tables involved in cross mapping

20 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Cross mapping SNOMED CT to ICD-9-CM

21 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Klassifikasjon vs. terminologi SNOMED CT NCSP

22 SNOMED CT-introduksjon • Jostein Ven, rådgiver, KITH, 03.11.05 Eksempel på begreper • core needle biopsy of kidney • maligjnant neoplasm of skin of lower limb • meningitis due to typhoid fever • entire paranasal sinus cavity • Begrepene i SNOMED er ikke dekomponert, så for eksempelbegrepene vet vi ikke hvilke deler som tilsvarer hvilke innholdelementer, selv om vi ut fra relasjonene har et utgangspunkt for et subsett av innholdselementene i begrepet.