Laste ned presentasjonen
Presentasjon lastes. Vennligst vent
PublisertTherese Marthinsen Endret for 9 år siden
1
Hovedoppgave Ved HIB/UIB Informatikk Bruk av MATLAB for visualisering og analyse av FREESURFER-segmenterte MRI-opptak av den aldrende hjerne Roy Kjellid
2
Bildediagnostikk Finnes flere ulike teknikker Klassifisere Røntgen
Ultralyd MRI Klassifisere Manuell klassifikasjon Automatisk klassifikasjon
3
MRI MRI ”oppfunnet” av Bloch og Purcell Stor utvikling siste 20 år
Segmenteringsteknikker Bildekvalitet Nye applikasjoner Applikasjoner Automatisk klassifikasjon FreeSurfer
4
”FREESURFER” Freesurfer er utviklet hos:
Cortechs og Martinos Center for Biomedisinsk Avbildning Martinos Center er et samarbeid Harvard-Massachusetts Institute of Technology (MIT) Massachusetts General Hospital.
5
Hva gjør FreeSurfer: Vevsgjenkjenning og morfometri basert på MRI
Freesurfer er det mest avanserte av slike verktøy
6
Hva gjør FreeSurfer: Tar utgangspunkt i ett eller flere T1-vektete 3D hodeopptak Automatisk segmentering av WM,GM,CSF Segmenterer også anatomiske strukturer
7
FreeSurfer FreeSurfer = Linux basert Visualiserings del i TCL/TK
Mål med oppgaven: dels innsikt gjennom visualisering dels tilrettelegging og gjennomføring av statistiske analyser av segmenterte volumer og flater
8
Teknologi Hvorfor Matlab? Negative sider: MATLAB, Matematisk verktøy
Mange ToolBoxes DICOM Virker på ulike plattformer Negative sider: Funksjons og script basert Bruker mye minne
9
VizFree VizFree Sentralisert Kontroll Arkitektur
Bildebehandling og Matlab
10
VizFree – Visualisere DICOM
11
VizFree – Visualisere FreeSurfer aseg
12
VizFree – Volum og hjernestruktur
13
VizFree – Tydelige Bilder
14
VizFree – 3D
15
VizFree - Gruppeanalyse
16
Hvorfor? Måle ulike volumendringer Effekt av medisinering
Sykdommer eller lidelser
17
Spørsmål?
18
HIB og Master…. Tilrettelegging? Software? Kompetanse?
Liknende presentasjoner
© 2024 SlidePlayer.no Inc.
All rights reserved.